Nachdem sich die beiden Lager um Captain America und Iron Man einen erbitterten Kampf am Leipziger Flughafen geliefert haben, verbünden sich Stark, Rogers und der Winter Soldier kurzzeitig, um Baron Zemo und dessen Plan zunichte zu machen. In einem ehemaligen HYDRA-Komplex stellen sie Zemo, der ihnen erzählt, dass seine Familie bei der Zerstörung von Sokovia durch die Avengers ums Leben kam. Zemo zeigt Iron Man Aufnahmen vom Tod seiner Eltern. Zu sehen ist, wie der durch HYDRA manipulierte Winter Soldier die Eltern von Stark ermordet. Daraufhin beginnt Iron Man den Winter Soldier zu bekämpfen, der von Captain America Unterstützung erhält. Nachdem der Metallarm vom Winter Soldier abgerissen wurde, besiegt Captain America Iron Man, in dem er dessen Kernreaktor mit seinem Schild zertrümmert. Iron Man zieht sich zurück, während sich der Winter Soldier wieder einfrieren lässt, um nicht mehr länger eine Gefahr darzustellen. Black Panther, der dem Trio hinterhergereist ist, nimmt Zemo in Gefangenschaft und überlässt ihn den deutschen Behörden. Nachdem Captain America Zuflucht in Black Panthers Heimat gefunden hat, befreit er zuletzt die gefangenen Avengers, die am Leipziger Flughafen festgenommen wurden. Schließlich schreibt Captain America an Stark einen versöhnlichen Brief, in dem er ihm seine Freundschaft erklärt, jedoch zu seinem Standpunkt steht. Nach dem Abspann, sieht man wie Peter Parker ein neues Gadget ausprobiert.