Im Jahr 2029 werden Mutanten nicht mehr natürlich geboren. Sie werden in speziellen Einrichtungen für militärische Zwecke gezüchtet. Der gealterte Logan, alias Wolverine, lebt zurückgezogen an der mexikanischen Grenze zusammen mit dem Mutanten Caliban und dem pflegebedürftigen Professor X. Eines Tages taucht die junge Mutantin Laura auf, die aus einer Militärbasis fliehen konnte und sich nun Logan anvertraut. Er soll das Kind bis nach North Dakota bringen, wo sie zusammen mit anderen Flüchtigen die Überfahrt ins sichere Kanada planen.