Alita tritt bei einem Motorballturnier an. Die anderen Teilnehmer wurden von Zalems Herrscher Nova angewiesen Alita zu töten. Alita kann ihre Widersacher besiegen. Unterdessen wird Alitas große Liebe Hugo von dem Kopfgeldjäger Zapan schwer verletzt. Durch die Hilfe der Ärztin Chiren kann Alita Hugos Kopf an ihr Herz anschließen. So kann sie ihn zu Dyson Ido bringen, der Hugos Kopf auf einen neuen Cyborg-Körper verpflanzt. Hugo wollte durch zwielichtige Geschäfte mit dem Motorball-Manager Vector, Zugang nach Zalem erhalten. Alita stellt diesen zur Rede und tötet dabei dessen Beschützer Grewishka. Zalems Herrscher Nova redet nun durch Vectors Körper mit Alita. Diese ersticht Vector und droht Nova damit, dass er sie unterschätzt habe. Hugo ist unterdessen aus Dyson Idos Praxis entflohen und versucht über eine Versorgungsröhre hinauf nach Zalem zu gelangen. Alita will ihn umstimmen. Gerade in diesem Moment wird Hugo von einem Verteidigungsring Zalems zerfetzt und stürzt von der Röhre in den Tod. Einige Zeit später ist Alita Teilnehmerin im Profifeld der Motorball-Meisterschaft. Sie zeigt mit ihrem Schwert in Richtung Zalem, während sie von Herrscher Nova dabei beobachtet wird.