Seit mehr als einem Jahrzehnt ist Jake Sully nun ein vollwertiges Mitglied der Na’vi und hat mit Neytiri eine Familie gegründet. Auf Pandora muss sich Jake in seiner Verantwortung als Stammesführer noch immer gegen die menschlichen Invasoren behaupten. Als sein Erzfeind Colonel Quaritch wieder auftaucht, dessen Geist in einen Na’vi-Körper überspielt wurde, beschließt Jake mit seiner Familie aus Sicherheitsgründen das Waldvolk zu verlassen. Sie finden Zuflucht bei den Metkayina, einem Na’vi-Stamm der die Küsten- und Insellandschaften Pandoras bewohnt und sich im Meer heimisch fühlt. Um ihre Außenseiterrolle ablegen zu können, wollen Jake und seine Familie die Gebräuche der Metkayina so schnell wie möglich erlernen. Parallel dazu befindet sich Quaritch auf einer gnadenlosen Jagd um Jake zu finden und Rache nehmen zu können.