Kurz vor Ende des zweiten Weltkriegs schafft es Indiana Jones einem Nazi-Schergentrupp die Hälfte einer mechanischen Uhr des antiken Mathematikers Archimedes abzunehmen. 25 Jahre später hat Indiana Peitsche und Hut an den Nagel gehängt und steht vor seiner Pensionierung als Uniprofessor. Parallel zu den Feierlichkeiten der erfolgreichen Mondlandung taucht Indys Patentochter Helena auf, welche die eine Hälfte von Archimedes Uhr gewinnbringend verkaufen möchte. Der Nazi Jürgen Voller, ein ehemaliger Widersacher Indys zu Kriegszeiten und jetziger NASA-Raketenwissenschaftler, hat es ebenfalls auf die Uhr abgesehen. Gemeinsam mit seiner Patentochter macht sich Indy auf die Suche nach der zweiten Hälfte der mechanischen Uhr, um den Nazis zuvorzukommen. Diese wollen die übernatürlichen Kräfte des Artefakts nutzen, um eine erneute Naziherrschaft heraufzubeschwören.