Nach dem Tod von Iceman wird Maverick ohne dessen schützende Hand von seinen Aufgaben als Ausbilder entbunden. Unerlaubt verschafft sich Maverick daraufhin Zugang zu einem der Düsenjets und beweist seinen einstigen Vorgesetzten und Rekruten, dass man den geplanten Einsatz tatsächlich fliegen kann. Beeindruckt von seinem fliegerischen Können, beauftragt man Maverick daraufhin die Staffel beim tatsächlichen Einsatz anzuführen und sich die weiteren Piloten auszusuchen. Als Wingman wählt Maverick zur Überraschung aller Rooster aus. Das hochgefährliche Manöver glückt und die Atomwaffenbasis des Gegners kann erfolgreich zerstört werden. Beim Rückflug wird Maverick jedoch abgeschossen, als er Rooster vor einer feindlichen Rakete gerettet hat. Maverick überlebt den Absturz, wird am Boden jedoch von einem Kampfhubschrauber angegriffen. Rooster kehrt zurück und rettet Maverick in letzter Sekunde, indem er den feindlichen Helikopter abschießen kann. Dies hat jedoch Roosters Abschuss zur Folge, den er aber auch überleben kann. Am Boden kämpfen sich beide zur gegnerischen Basis durch, wo sie in einem Hangar das Auslaufmodell eines F14-Kampfjets übernehmen. Damit treten sie den Rückflug zum Flugzeugträger an. Unterwegs geraten sie jedoch in die Verfolgung der feindlichen Kampfjets, die der F-14 technologisch hochüberlegen sind. Maverick setzt all seine Erfahrung und sein fliegerisches Können ein, um die beiden gegnerischen Jets abzuschießen. Dies gelingt ihm. Als ihnen jedoch ein allerletzter feindlicher Flieger im Nacken sitzt, haben sie keine Abwehrraketen mehr und der Schleudersitz hat einen technischen Defekt. In dem Moment, als der feindliche Pilot Maverick und Rooster in seinem Fadenkreuz hat, wird er von Hangman abgeschossen, der den beiden vom Flugzeugträger aus zu Hilfe geeilt ist. Da die F-14 schwer beschädigt ist und zudem ihr Landerad verloren hat, muss Maverick das Flugzeug unsanft landen. Mittels eines Fangnetzes kann die Crew des Flugzeugträgers die Maschine zum stoppen bringen, ehe Maverick und Rooster wieder auf die Gruppe treffen und für ihren Einsatz gefeiert werden. Zum Schluss haben sich Maverick und Rooster wieder versöhnt und schrauben gemeinsam in einem Hangar an einem alten Flugzeug. Als die Barbesitzerin Penny auftaucht, fährt Maverick mit ihr in den Sonnenuntergang.

Dean geht mit seiner Arbeitskollegin Fiona auf eine Geschäftsreise nach Mexiko. Laura und ihr Vater reisen Dean hinterher, in dem Glauben, ihn in flagranti zu erwischen. Als Laura das Hotelzimmer von Fiona beobachtet, erhält sie einen Anruf ihres Mannes Dean, der vorzeitig aus Mexiko abgereist ist, um Zeit mit seiner Familie in New York zu verbringen. Fiona selbst bestätigt, dass Dean ihr sein Zimmer überlassen hat und abgereist ist, woraufhin klar wird, dass es niemals eine Affäre gegeben hat. Nachdem sie sich von ihrem Vater im Streit verabschiedet hat, kehrt Laura mit dem erstbesten Flug nach New York zurück. Sie entschuldigt sich bei ihrem Ehemann. Sie erklärt ihm die Situation und auch er entschuldigt sich bei ihr dafür, dass er ihr das Gefühl gegeben hat, nicht mehr wichtig zu sein. Nach der Aussprache mit ihrem Mann kommt Laura über ihre Schreibblockade hinweg. Vor ihrer Wohnung versöhnt sie sich außerdem wieder mit ihrem Vater. Zum Schluss reicht Dean seiner Frau bei einem Dinner in einem feinen Restaurant ein Geburtstagsgeschenk in Form einer Armbanduhr nach.

Mit dem Space-Shuttle reisen die drei Protagonisten in das Innere des Mondes. In einer Art Hangar wird Brian Harper der Grund der Mondkatastrophe erklärt: Die Vorfahren der Menschheit haben eine künstliche Intelligenz erschaffen, die außer Kontrolle geraten ist und sich gegen ihre Schöpfer gestellt hat. Um die Menschheit vor dem Aussterben zu retten, haben sie in einem weiter entfernteren Sonnensystem den Mond erschaffen, woraufhin die Erde entstanden ist. Auf diesem neu geschaffenen Planeten haben die Vorfahren der Menschheit ihren genetischen Code hinterlassen, woraus die Spezies Mensch entstanden ist. Vor Jahren haben die Nanopartikel der außer Kontrolle geratenen künstlichen Intelligenz die Erde entdeckt, weshalb diese begonnen hat, den Mond aus seiner Umlaufbahn zu drängen, um sowohl die Erde als auch ihren Trabanten zu zerstören. Während Brian Harper und Fowler es schaffen auf die Erdoberfläche zurückzukehren, bleibt der Verschwörungstheoretiker Houseman zurück und opfert sich. Mittels eines leistungsstarken EMP den er händisch auslösen muss, setzt er die künstliche Intelligenz außer Gefecht, woraufhin der Mond wieder in seine Umlaufbahn zurückbefördert wird. Auf der teilweise stark zerstörten Erde wird Brian Harper mit seinem Sohn wiedervereint.

Maurizio lässt sich von Patrizia scheiden und beginnt eine Beziehung mit seiner Jugendliebe Paola. In der Zwischenzeit schafft es Maurizio seinen Onkel und Cousin aus dem Unternehmen zu drängen und sich die Führung des Konzerns mit einer irakischen Investorengruppe zu teilen, mit denen er plant, Gucci zu neuem Glanz zu verhelfen. Unter dem Einfluss einer Kartenlegerin heuert die eifersüchtige Patrizia zwei Auftragsmörder an, um ihren Ex-Ehemann ermorden zu lassen. Am 27. März 1995 wird Maurizio von einem der beiden Killer vor dem Firmensitz in Mailand erschossen. Im Nachgang werden die beiden Killer, die Kartenlegerin und Patrizia selbst zu mehrjährigen Haftstrafen verurteilt.